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Actualmente el filial milita en La 3ª RFEF, camiseta real madrid Su organización corre a cargo de la misma Real Federación Española de Fútbol. Las cuestiones de justicia deportiva son competencia de la Real Federación Española de Fútbol a través de sus Comités de Disciplina Deportiva: Comité de Competición, Jueces de Competición y Comité de Apelación. El posterior triunfo de la squadra azzurra por 2 a 0 sobre Paraguay fue solo para las estadísticas. Es la segunda temporada del entrenador Unai Emery al frente del equipo, y el Valencia logra regresar a la Liga de Campeones tras quedar 3.er clasificado en la Liga, con 8 puntos de ventaja sobre el 4.º clasificado. Aun así el club renovó a Unai Emery por una temporada más, la que sería su cuarta temporada al frente del equipo, convirtiéndose así en uno de los entrenadores con más temporadas en la historia del club. Con el club ya en manos del máximo accionista y presidente, Juan Soler, se incorporan al equipo, gracias al trabajo del director deportivo Javier Subirats, futbolistas como David Villa, Patrick Kluivert, Miguel Brito o Edu. Una de las primeras decisiones del entrenador fue apartar del equipo a tres futbolistas: David Albelda, Santiago Cañizares y Miguel Ángel Angulo.
Destituían también a Miguel Ángel Ruiz como director deportivo, un puesto que desaparecía en el nuevo organigrama del club y nombraban a Juan Sánchez como director deportivo. El club, a través de Mateu Alemany, ratificó a Marcelino García Toral como técnico a pesar de la mala dinámica y de lo lejos que estaba el objetivo del club. En lo deportivo el equipo consigue el objetivo de volver a la Liga de Campeones al quedar 4.º clasificado, y realiza un buen papel en la Liga de Campeones al superar a AS Roma, Shakhtar Donetsk, Olympiacos FC e Inter de Milán, este último en una disputada eliminatoria cuerpo a cuerpo que terminó con una espectacular pelea al finalizar el encuentro de vuelta en Mestalla que tuvo lugar sobre el césped y en los vestuarios. Tras un inicio dubitativo, el equipo logró centrarse en su único objetivo y consiguió quedar 3.º, camiseta barcelona 2024 con Villa como goleador destacado con 25 goles.
Copa del Rey cae contra el Sevilla en cuartos de final tras no aprovechar sus ventajas en el marcador y gracias a un gol del equipo andaluz en clamoroso fuera de juego en el partido de ida en Mestalla. Pese a los malos resultados en Liga con el equipo cada vez más cerca de los puestos de descenso, el Valencia va superando eliminatorias en la Copa del Rey ante el Real Unión de Irún, el Real Betis, el Atlético de Madrid y el FC Barcelona en semifinales, consiguiendo así disputar la final de la Copa del Rey el 16 de abril de 2008 en el estadio Vicente Calderón contra el Getafe CF. Por otra parte en la Liga de Campeones se clasificó para los octavos de final al hacer en la fase de grupos los mismos números que el Bayern de Múnich, haciendo además un épico partido frente a los alemanes en Mestalla donde se empató 1-1 pero el Valencia estuvo cerca de ganar jugando con un hombre menos. Carlos Iturraspe San Sebastián, 1910 Valencia C.F. Mediocampistas: 8 Francisco Valdés , 10 Carlos Reinoso, 14 Alfonso Lara, 16 Guillermo Páez, 17 Guillermo Yávar, 18 Jorge Socías, 19 Rogelio Farías. Algunos de los futbolistas clave de estos éxitos fueron Pablo Aimar, Vicente Rodríguez, David Albelda, Rubén Baraja, Mista, Xisco, Fábio Aurélio, Curro Torres, Carlos Marchena, Roberto Ayala, Amedeo Carboni, Ricardo Oliveira, Mauricio Pellegrino y Santiago Cañizares.
Antes de dejar el club, el exfutbolista dejó atados los fichajes de Feghouli, Topal y Ricardo Costa. El equipo pasa a manos de Voro, exfutbolista del Valencia que ocupaba el cargo de delegado del equipo y que disponía de carnet de entrenador. El Valencia queda 3.º con 9 puntos de ventaja sobre el 4.º y 13 sobre el 5.º. En la Copa del Rey es eliminado por el Villarreal CF en octavos de final tras nuevamente dejarse remontar un marcador a favor (como en las temporadas anteriores), y en la Liga de Campeones alcanza también los octavos de final, donde es eliminado por el Schalke 04 alemán, equipo que a priori no era superior al Valencia, lo cual produjo una fuerte decepción en el entorno valencianista. Diseñada por iniciativa de la organización Parley for the Oceans para crear conciencia sobre la contaminación que están recibiendo los océanos del mundo y de la urgente necesidad por crear planes de reciclaje para su erradicación, únicamente se usó en un partido, el 26 de noviembre de 2016 ante el Real Sporting de Gijón. ↑ «Garra charrúa: Uruguay lo empató sobre el final, se impuso en los penales y se quedó con el tercer puesto».