Por ello todas las miradas del fútbol colombiano se volcaron sobre la Copa Colombia, francia camiseta donde todos los equipos jugaban con sus respectivas escuadras camiseta de españa 2024 titulares. Además en este predio hacen de local los equipos de Hockey sobre césped femenino y masculino. La final de este campeonato la disputaría con Independiente Santa Fe; donde empataron 0-0 en el primer choque en el Estadio Eduardo Santos, y en el partido definitorio cayó derrotado en Bogotá con un marcador 2-1, otorgándole el título al cuadro Cardenal, consiguiendo así el subcampeonato para el Ciclón. Allí, ganó el Grupo B superando a Santa Fe, Deportivo Cali y Once Caldas. A, del cual salió el campeón de ese torneo, el Once Caldas. En su condición de campeón del fútbol colombiano, el Unión Magdalena integró el Grupo 1 de la Copa Libertadores 1969 junto al Deportivo Cali y los clubes venezolanos Deportivo Italia y Deportivo Canarias. El Unión ganó dos partidos, ambos como local 1-0 a Deportivo Canarias y 3-0 a Deportivo Italia, lo cual no le alcanzó para clasificar a la ronda de los cuartos de final. El descenso a pesar de la buena nómina con la que contaba el Unión Magdalena se debió al desorden administrativo que lo aquejó y que hasta estos días se mantiene.
A pesar de superar en la tabla final al Expreso Palmira y al Deportivo Rionegro, el Deportivo Pereira ganó el campeonato con 15 puntos, cinco más que el Unión, que debió quedarse un año más en la «B». Pero el equipo no participó en la fase final de ninguno de los dos torneos. La misma corresponde al período profesional iniciado en el año 1931, abarcando todos los certámenes nacionales disputados al día de hoy: Campeonatos de primera división, Torneos Metropolitano y Nacional, Torneos Apertura y Clausura. En su regreso a Primera División en 2002, clasificando a los cuadrangulares semifinales del Torneo Apertura. La Copa contó con la participación de 32 equipos entre Primera División, Segunda División y Segunda División «B». Unión Magdalena debutó en el año 2000 en la Segunda División, la Primera B, llegando al cuadrangular final del año. La década de 1970 tuvo al Unión Magdalena ubicado generalmente en la mitad de la tabla. La Asamblea General de la Dimayor aprobó la expansión de equipos en la Primera A de 16 a 18 equipos, lo cual hizo que se realizará un triangular de ascenso entre el descendido del 2001, Atlético Bucaramanga, y los dos afiliados a la Dimayor en la Primera B, Cúcuta Deportivo y Unión Magdalena.
Luego de ser cuarto durante el año con 56 puntos, Unión estaba en los cuadrangulares semifinales, Grupo B, como líder con 7 puntos, las mismas unidades del Atlético Nacional, y superando a Santa Fe y Deportes Quindío, pero el asesinato del árbitro Álvaro Ortega hizo que la Dimayor declarara desierto el campeonato. Álvaro Ortega, por lo que no hubo campeón. En 2001, el Unión regresó al cuadrangular final de la Primera B, pero apenas pudo superar en la tabla al Bogotá Chicó, ya que el Deportivo Rionegro y el campeón Deportes Quindío lo superaron en la tabla definitiva. Durante la celebración por el título samario, falleció un hincha atropellado, y cuentan que se convirtió en la «Maldición de la Celebración» por ello el Unión Magdalena no ha vuelto a quedar campeón. No obstante, al final de la década, en 1979, el Unión tuvo una destacada participación. No obstante, en una apretada semifinal, el ‘Ciclón’ fue eliminado por Deportivo Cali, y superado en la tabla por Millonarios. En una vibrante semifinal, el Unión Magdalena disputó la clasificación a la final con su clásico rival, el Junior. La tendencia del Unión de permanecer en la mitad de la tabla continuó en esta década.
En 1998, había llegado el primer campanazo de alerta para los samarios, luego de quedar en el penúltimo lugar de la tabla de posiciones con 50 puntos en igual número de partidos. El Torneo Finalización fue una de las mejores campañas del Unión en mucho tiempo al clasificar tercero a los cuadrangulares con 28 puntos. Fue para el partido de la Liga Europa frente al Bayer Leverkusen que se jugó en Leverkusen en el que el conjunto colchonero quedó eliminado al empatar el partido a uno y terminar tercero de su grupo. La gran final del año tuvo al Deportivo Cali como local contra el Unión en el partido de ida. La participación en la Copa Libertadores se reflejó en el Campeonato Colombiano, debido a que el Unión Magdalena finalizó último de la reclasificación (puesto 14 con 38 puntos). La selección alemana quedó en el grupo A junto con Escocia, Hungría y Suiza, en su debut se impuso ante los escoceses por una goleada de 5 a 1, posteriormente lograrón una victoria por 2 a 0 ante el conjunto húngaro, asegurando su clasificación a los octavos de final y en la última fecha de la fase de grupos obtuvieron un empate agónico de 1 a 1 ante el conjunto helvético, logrando el liderato de su grupo con 7 puntos.